Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
HECW1Q76N89 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HECW1Q76N89 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HECW1Q76N89 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HECW1Q76N89 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
HECW1Q76N89 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms