Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00299Q6ZSB3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms