Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZRN4Q6ZMN7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN4Q6ZMN7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms