Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L3Q6VB84 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms