Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKAL1Q6UXT8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKAL1Q6UXT8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms