Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBR1LQ6UX01 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1LQ6UX01 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms