Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L2Q6R6M4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms