Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A47Q6Q0C1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms