Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKN3Q6P5Z2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms