Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KANK3Q6NY19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KANK3Q6NY19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KANK3Q6NY19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms