Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGMBQ6NW40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms