Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms