Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms