Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSAPQ6IQ19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCSAPQ6IQ19 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCSAPQ6IQ19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCSAPQ6IQ19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCSAPQ6IQ19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCSAPQ6IQ19 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCSAPQ6IQ19 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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