Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCAPH2Q6IBW4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPH2Q6IBW4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms