Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP4Q6FHJ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms