Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms