Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3L3Q68CJ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms