Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA1Q5VX52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA1Q5VX52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms