Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms