Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms