Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRIP1Q5VSL9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms