Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO4Q5TGY1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO4Q5TGY1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms