Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms