Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms