Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSL3PQ5NE16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms