Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKR3Q5GH77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms