Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR4Q5GH76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR4Q5GH76 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR4Q5GH76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms