Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms