Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE2Q495Y8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE2Q495Y8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE2Q495Y8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms