Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT71Q3SY84 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms