Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms