Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTC1Q2NKJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms