Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC142Q17RM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC142Q17RM4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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