Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
FOXD1Q16676 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
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FOXD1Q16676 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
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