Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGISQ16647 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGISQ16647 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms