Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM1Q16610 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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