Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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