Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MRPL23Q16540 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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