Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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