Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZNF56Q15929 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF56Q15929 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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