Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USF2Q15853 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USF2Q15853 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USF2Q15853 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
USF2Q15853 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USF2Q15853 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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