Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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