Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF1Q15637 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SF1Q15637 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF1Q15637 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF1Q15637 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF1Q15637 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF1Q15637 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF1Q15637 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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