Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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