Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHHQ15465 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHHQ15465 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHHQ15465 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHHQ15465 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHHQ15465 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHHQ15465 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHHQ15465 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHHQ15465 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHHQ15465 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHHQ15465 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHHQ15465 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHHQ15465 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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