Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TLR1Q15399 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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