Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF4Q15306 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF4Q15306 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IRF4Q15306 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF4Q15306 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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