Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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