Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PDCD1Q15116 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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